Variasi Genetik Lobster Hijau Pasir (Panulirus homarus L.) Di Teluk Bumbang Pulau Lombok Berdasarkan Penanda Inter Simple Sequence Repeats (ISSR)

Yudha Perdana Putra

Abstract


Panulirus homarus merupakan salah satu jenis lobster yang memiliki nilai ekonomis tinggi dan paling banyak ditangkap serta dibudidayakan di wilayah perairan Teluk Bumbang Pulau Lombok. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui variasi genetik P. homarus di Teluk Bumbang dengan menggunakan penanda Inter-Simple Sequence Repeats (ISSR). Amplifikasi DNA dilakukan dengan metode PCR-ISSR menggunakan primer ISSR1 dan ISSR3. Analisis data dilakukan dengan metode UPGMA untuk menkonstruksi dendrogram. Karakter morfologi berupa rasio lebar/panjang tubuh dan pola warna tidak menunjukkan perbedaan signifikan antara individu. Total lokus polimorfik yang teramplifikasi sebanyak 16 loci dengan rata-rata persentase polimorfisme sebesar 64%. Dendogram menunjukkan hubungan fenetik antara individu yang relatif tinggi. Rata-rata nilai similaritas karakter genetis daerah ISSR P. homarus di Teluk Bumbang sebesar 61,6%.

Keywords


Panulirus homarus, Teluk Bumbang, variasi genetik, ISSR, hubungan fenetik

Full Text:

PDF

References


Berry, P. F. 1974. A Revision of the Panulirus homarus-Group of Spiny Lobsters (Decapoda, Palinuridae). Crustaceana 27(1): 31-42.

Britto, F. B., Mendes, D. S. F., Ogawa, M., Cintra, I. H. A. & Diniz, F. M. 2011. Single Primer-Based DNA Amplification as A Suitable and Low-Cost Tool for Assessing Genetic Diversity in Mangrove Crabs. Genetic and Molecular Research 10(4): 4084-4092.

Chow, S., Jeffs, A., Miyake, Y., Konishi, K., Okazaki, M., Suzuki, N., Abdullah, M.F., Imai, H., Wakabayasi, T. & Sakai, M. 2011. Genetic Isolation Between the Western and Eastern Pacific Population of Pronghorn Spiny Lobster Panulirus penicillatus. PLoS ONE 6(12): e29280.

Fernandez, M. V., Maltagliati, F., Pennaciulli, F. G. & Roldan, M. I. 2011. Analysis of Genetic Variability in Aristaeomorpha foliacea (Crustacea, Aristeidae) Using DNA-ISSR (Inter Simple Sequence Repeats) Markers. Comptes Rendus Biologies 334: 705-712.

Girsang, E., Kristanto, A. H., Hadi, W. & Mardlijah, S. 2007. Karakterisasi Biometrik Lobster (Panulirus homarus) Dari Beberapa Lokasi. Lokakarya Nasional Pengelolaan dan Perlindungan Sumber Daya Genetik di Indonesia: 298-306.

Junaidi, M., Cokrowati, N. & Abidin, Z. 2010. Aspek Reproduksi Lobster (Panulirus sp.) di Perairan Teluk Ekas Pulau Lombok. Jurnal KELAUTAN 3(1): 29-35.

Leslie, V. A., Rathinam, M. M. & Anusha, B. 2012. Distribution Profile of Vibrio harveyi in Panulirus homarus. International Research Journals of Biological Science 1(4): 61-64.

Priyambodo, B. & Sarifin. 2009. Lobster Aquaculture Industry in Eastern Indonesia: Present Status and Prospects. ACIAR Proceedings 132: 36-45.

Priyambodo, B., Jones, C. & Shanks, S. 2011. Abstract: Review of Spiny Lobster Aquaculture in Indonesia. The 9th International Conference and Workshop On Lobster Biology And Management: 24.

Schulz, H. K., Śmietana, P. & Schulz, R. 2004. Assessment of DNA Variations of the Noble Crayfish (Astacus astacus L.) in Germany and Poland Using Inter-Simple Sequence Repeats (ISSRs). Bull. Fr. Pêche Piscic 372-373: 387-399.

Yudianto. “Budidaya Dan Pemasaran Udang Lobster Air Tawar.” Mitra Usaha Tani, 4 Apr. 2020, www.mitrausahatani.com/2020/04/budidaya-dan-pemasaran-udang-lobster.html.

Spooner, D., Treuren, R. V. & de Vicente, M. C. 2005. Molecular Markers for Genebank Management. International Plant Genetic Resources Institute. Rome.

Ungherese, G., Mengoni, A., Somigli, S., Baroni, D., Focardi, S. & Ugolini, A. 2010. Relationship Between Heavy Metals Pollution and Genetic Diversity in Mediterranean Populations of the Sandhopper Talitrus saltator (Montagu) (Crustacea, Amphipoda). Enviromental Pollution 158: 1638-1643.

Zietkiewicz, E., Rafalski, A. & Labuda, D. 1994. Genome Fingerprinting by Simple Sequence Repeat (SSR)-Anchored Polymerase Chain Reaction Amplification. Genomics 20: 176-183.




DOI: http://dx.doi.org/10.26418/lkuntan.v1i3.29857

Refbacks

  • There are currently no refbacks.


Bookmark and Share


Copyright © 2021 Jurnal Laut Khatulistiwa, except certain content provided by third parties. This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Free counters!